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原因1、一般纳税人的票据难处理
代理公司每个月都要取得客户的发票整理成专业的会计凭证。一般纳税人由于营业额较高，所以涉及的票据通常也比小规模纳税人多。
而且一般纳税人涉及到增值税专用发票的进项票的认证和抵扣，操作较为复杂。代账公司通常会取送凭证和跟客户确认很多细节。
原因2、报税流程复杂，控制税负
在报税方面，小规模纳税人的增值税是按季申报的，而一般纳税人是按月申报。一般纳税人每次要填写的申报表也多了很多，特别是增值税申报麻烦且次数多。
另外一般纳税人月初要及时抄报税，月底还要及时认证进项票；还必须控制税负：税缴多和缴税太低都不适合。
原因3、做账需谨慎，经常被抽查
因为一般纳税人涉及到进项票抵扣，而税局现在查进项票抵扣非常严，所以一般纳税人在做账上面的要求高，比如代理公司会每个月及时处理客户提供的银行对账单、工资明细、各种入账单据等等，而且要设置明细核算。
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